Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms