Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms