Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms