Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTV1Q96GA3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms