Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms