Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF1Q92879 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms