Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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