Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms