Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms