Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHA9Q7RTU4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms