Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms