Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRINP3Q76B58 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms