Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf139Q6ZV77 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms