Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms