Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC9Q6ZRR7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms