Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms