Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
ANKRD54Q6NXT1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms