Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms