Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRC8EQ6NSJ5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms