Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms