Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB2Q5VUJ9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms