Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF220Q5VTB9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms