Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms