Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms