Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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