Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
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FOXD1Q16676 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD1Q16676 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
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