Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACKR1Q16570 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms