Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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