Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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