Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SYCP1Q15431 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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