Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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