Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM1Q15032 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms