Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TNIP1Q15025 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP1Q15025 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms