Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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