Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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GBX1Q14549 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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GBX1Q14549 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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GBX1Q14549 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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