Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
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