Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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