Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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