Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FOXF1Q12946 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FOXF1Q12946 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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