Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP53BP1Q12888 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TP53BP1Q12888 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms