Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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GTF3C1Q12789 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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