Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms