Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms