Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms