Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms