Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms