Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN2Q02246 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN2Q02246 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms