Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XPCQ01831 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XPCQ01831 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XPCQ01831 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
XPCQ01831 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XPCQ01831 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XPCQ01831 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPCQ01831 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPCQ01831 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms