Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms