Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms